«Енисей» следует по маршруту Москва — Красноярск через день. Из столицы состав отправляется по нечетным датам. Из Красноярска – по четным.
Протяженность маршрута 3955 км. Время в пути из Красноярска в Москву – 61 час 20 минут, в обратном направлении – 60 часов 34 минуты. В пути поезд пересекает четыре часовых пояса. Максимальная скорость – 160 км/час, средняя – 120 км/час.
Маршрут поезда Енисей 056Ы из Москвы в Красноярск
| Станция | Отправление | Стоянка | Прибытие | В пути |
| Москва Ярославская | 16:20 | — | — | — |
| Владимир | 19:53 | 26 м | 19:27 | 3 ч 7 м |
| Ковров-1 | 21:01 | 2 м | 20:59 | 4 ч 39 м |
| Дзержинск | 22:34 | 2 м | 22:32 | 6 ч 12 м |
| Нижний Новгород Моск. | 23:12 | 12 м | 23:00 | 6 ч 40 м |
| Урень | 01:27 | 2 м | 01:25 | 9 ч 5 м |
| Шахунья | 02:16 | 2 м | 02:14 | 9 ч 54 м |
| Котельнич-1 | 03:54 | 2 м | 03:52 | 11 ч 32 м |
| Киров Пасс | 05:28 | 16 м | 05:12 | 12 ч 52 м |
| Зуевка | 06:55 | 2 м | 06:53 | 14 ч 33 м |
| Яр | 07:50 | 1 м | 07:49 | 15 ч 29 м |
| Глазов | 08:22 | 2 м | 08:20 | 16 ч |
| Балезино | 09:14 | 26 м | 08:48 | 16 ч 28 м |
| Пермь-2 | 13:48 | 29 м | 13:19 | 20 ч 59 м |
| Екатеринбург Пасс. | 19:41 | 33 м | 19:08 | 1 д 2 ч 48 м |
| Тюмень | 00:42 | 20 м | 00:22 | 1 д 8 ч 2 м |
| Ишим | 04:37 | 15 м | 04:22 | 1 д 12 ч 2 м |
| Называевская | 06:15 | 2 м | 06:13 | 1 д 13 ч 53 м |
| Омск | 08:04 | 18 м | 07:46 | 1 д 15 ч 26 м |
| Калачинская | 09:14 | 2 м | 09:12 | 1 д 16 ч 52 м |
| Татарская | 10:16 | 2 м | 10:14 | 1 д 17 ч 54 м |
| Барабинск | 12:26 | 30 м | 11:56 | 1 д 19 ч 36 м |
| Обь | 15:29 | 2 м | 15:27 | 1 д 23 ч 7 м |
| Новосибирск-Главный | 16:39 | 51 м | 15:48 | 1 д 23 ч 28 м |
| Юрга-1 | 19:01 | 2 м | 18:59 | 2 д 2 ч 39 м |
| Тайга | 20:07 | 4 м | 20:03 | 2 д 3 ч 43 м |
| Анжерская | 20:40 | 2 м | 20:38 | 2 д 4 ч 18 м |
| Яя | 21:05 | 2 м | 21:03 | 2 д 4 ч 43 м |
| Ижморская | 21:24 | 2 м | 21:22 | 2 д 5 ч 2 м |
| Мариинск | 22:55 | 26 м | 22:29 | 2 д 6 ч 9 м |
| Боготол | 01:02 | 2 м | 01:00 | 2 д 8 ч 40 м |
| Ачинск-1 | 02:02 | 6 м | 01:56 | 2 д 9 ч 36 м |
| Красноярск Пасс | — | — | 04:54 | 2 д 12 ч 34 м |
Маршрут поезда Енисей 056Ы из Москвы в Красноярск на карте
Маршрут поезда Енисей 055Ы из Красноярска в Москву
| Станция | Отправление | Стоянка | Прибытие | В пути |
| Красноярск Пасс | 16:32 | — | — | — |
| Ачинск-1 | 19:52 | 5 м | 19:47 | 3 ч 15 м |
| Боготол | 21:02 | 2 м | 21:00 | 252 км |
| Мариинск | 23:31 | 26 м | 23:05 | 6 ч 33 м |
| Анжерская | 01:08 | 2 м | 01:06 | 8 ч 34 м |
| Тайга | 01:38 | 3 м | 01:35 | 9 ч 3 м |
| Юрга-1 | 02:41 | 2 м | 02:39 | 10 ч 7 м |
| Новосибирск-Главный | 05:24 | 41 м | 04:43 | 12 ч 11 м |
| Обь | 05:46 | 2 м | 05:44 | 13 ч 12 м |
| Барабинск | 09:56 | 30 м | 09:26 | 16 ч 54 м |
| Татарская | 11:56 | 2 м | 11:54 | 19 ч 22 м |
| Калачинская | 13:10 | 2 м | 13:08 | 20 ч 36 м |
| Омск | 14:42 | 26 м | 14:16 | 21 ч 44 м |
| Называевская | 16:37 | 2 м | 16:35 | 1 д 0 ч 3 м |
| Ишим | 18:29 | 15 м | 18:14 | 1 д 1 ч 42 м |
| Екатеринбург Пасс. | 03:32 | 33 м | 02:59 | 1 д 10 ч 27 м |
| Пермь-2 | 09:44 | 20 м | 09:24 | 1 д 16 ч 52 м |
| Балезино | 13:55 | 26 м | 13:29 | 1 д 20 ч 57 м |
| Глазов | 14:23 | 2 м | 14:21 | 1 д 21 ч 49 м |
| Яр | 14:54 | 1 м | 14:53 | 1 д 22 ч 21 м |
| Зуевка | 15:46 | 2 м | 15:44 | 1 д 23 ч 12 м |
| Киров Пасс | 17:26 | 15 м | 17:11 | 2 д 0 ч 39 м |
| Котельнич-1 | 18:50 | 2 м | 18:48 | 2 д 2 ч 16 м |
| Шахунья | 20:22 | 2 м | 20:20 | 2 д 3 ч 48 м |
| Урень | 21:04 | 2 м | 21:02 | 2 д 4 ч 30 м |
| Нижний Новгород Моск. | 23:23 | 12 м | 23:11 | 2 д 6 ч 39 м |
| Дзержинск | 23:52 | 2 м | 23:50 | 2 д 7 ч 18 м |
| Ковров-1 | 01:30 | 2 м | 01:28 | 2 д 8 ч 56 м |
| Владимир | 02:47 | 26 м | 02:21 | 2 д 9 ч 49 м |
| Москва Ярославская | — | — | 05:52 | 2 д 13 ч 20 м |
Маршрут поезда Енисей 055Ы из Красноярска в Москву на карте